Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc2Q9CQP2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc2Q9CQP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 275.6 ms