Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccer1Q9CQL2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccer1Q9CQL2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms