Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ncbp2Q9CQ49 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ncbp2Q9CQ49 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms