Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rnf17Q99MV7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf17Q99MV7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms