Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gins4Q99LZ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gins4Q99LZ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms