Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms