Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RtcbQ99LF4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RtcbQ99LF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RtcbQ99LF4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms