Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q99KU6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q99KU6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q99KU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q99KU6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q99KU6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q99KU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q99KU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q99KU6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms