Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krcc1Q99JT5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Krcc1Q99JT5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms