Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pacsin3Q99JB8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms