Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clip1Q922J3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Clip1Q922J3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms