Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh3bp4Q921I6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh3bp4Q921I6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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