Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Afg3l1Q920A7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Afg3l1Q920A7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l1Q920A7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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