Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf6Q91YR7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf6Q91YR7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms