Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cabp4Q8VHC5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cabp4Q8VHC5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms