Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Fyco1Q8VDC1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fyco1Q8VDC1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fyco1Q8VDC1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms