Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Med17Q8VCD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med17Q8VCD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms