Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8R2K8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8R2K8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms