Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hecw1Q8K4P8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hecw1Q8K4P8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms