Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fbxo18Q8K2I9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fbxo18Q8K2I9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms