Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Depp1Q8K2F3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms