Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d23Q8K0F1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d23Q8K0F1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Tbc1d23Q8K0F1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tbc1d23Q8K0F1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tbc1d23Q8K0F1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms