Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rasgef1bQ8JZL7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms