Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG3

Gcc2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc2Q8CHG3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcc2Q8CHG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc2Q8CHG3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc2Q8CHG3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms