Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Parp11Q8CFF0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms