Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl1Q8CEQ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms