Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc178Q8CDV0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms