Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Lrrc9Q8CDN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lrrc9Q8CDN9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms