Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atg4aQ8C9S8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atg4aQ8C9S8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atg4aQ8C9S8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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