Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cwc22Q8C5N3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cwc22Q8C5N3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc22Q8C5N3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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