Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp40Q8BWR4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp40Q8BWR4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
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