Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Usp54Q8BL06 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp54Q8BL06 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp54Q8BL06 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms