Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdca8Q8BHX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdca8Q8BHX3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms