Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4dQ8BGV9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms