Protein–RNA interactions for Protein: Q811B3

Adamts12, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts12Q811B3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Adamts12Q811B3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Adamts12Q811B3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Adamts12Q811B3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms