Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSV6

Got1l1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1l1Q7TSV6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Got1l1Q7TSV6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Got1l1Q7TSV6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Got1l1Q7TSV6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Got1l1Q7TSV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Got1l1Q7TSV6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms