Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp6r1Q7TSI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppp6r1Q7TSI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms