Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Tnfsf18Q7TS55 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tnfsf18Q7TS55 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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