Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ShprhQ7TPQ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ShprhQ7TPQ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms