Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver2Q7TPD6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver2Q7TPD6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Raver2Q7TPD6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms