Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Uhrf2Q7TMI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Uhrf2Q7TMI3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms