Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vma21Q78T54 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms