Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nup188Q6ZQH8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup188Q6ZQH8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms