Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Topbp1Q6ZQF0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Topbp1Q6ZQF0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Topbp1Q6ZQF0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms