Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ino80Q6ZPV2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ino80Q6ZPV2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ino80Q6ZPV2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms