Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc44a1Q6X893 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc44a1Q6X893 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc44a1Q6X893 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms