Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sort1Q6PHU5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sort1Q6PHU5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms