Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scaf4Q6PFF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms