Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slf2Q6P9P0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slf2Q6P9P0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slf2Q6P9P0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms