Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam222bQ6P539 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam222bQ6P539 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms